Skip to Main Content
Table 3

Assignment of E. coli isolates to host source in a four-way categorical split

MarkerHost sourceNRate of classification (%) of E. coli isolates in the assigned group
ARCC (%)
ChickenCowPigSewage
BOX Chicken 40 67.50 10.00 10.00 10.00 76.25 
Cow 40 17.50 82.50 5.00 10.00 
Pig 40 12.50 5.00 80.00 7.50 
Sewage 40 5.00 5.00 5.00 75.00 
GTG Chicken 40 70.00 12.50 17.50 15.00 64.38 
Cow 40 7.50 67.50 12.50 12.50 
Pig 40 17.50 15.00 62.50 15.00 
Sewage 40 5.00 5.00 7.50 57.50 
BOX–GTG Chicken 30 73.33 6.67 10.00 10.00 74.17 
Cow 30 10.00 76.67 10.00 10.00 
Pig 30 10.00 10.00 73.33 6.67 
Sewage 30 6.67 6.67 6.67 73.33 
MarkerHost sourceNRate of classification (%) of E. coli isolates in the assigned group
ARCC (%)
ChickenCowPigSewage
BOX Chicken 40 67.50 10.00 10.00 10.00 76.25 
Cow 40 17.50 82.50 5.00 10.00 
Pig 40 12.50 5.00 80.00 7.50 
Sewage 40 5.00 5.00 5.00 75.00 
GTG Chicken 40 70.00 12.50 17.50 15.00 64.38 
Cow 40 7.50 67.50 12.50 12.50 
Pig 40 17.50 15.00 62.50 15.00 
Sewage 40 5.00 5.00 7.50 57.50 
BOX–GTG Chicken 30 73.33 6.67 10.00 10.00 74.17 
Cow 30 10.00 76.67 10.00 10.00 
Pig 30 10.00 10.00 73.33 6.67 
Sewage 30 6.67 6.67 6.67 73.33 

Values shown are means obtained from 100 iterations of the DAPC. N indicates the number of isolates from each host source. The percentages of isolates that were correctly assigned are in bold.

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal